R -- experimental code     [ not functional at the moment ]

0all

0.source.R
adaptScale.R
bablok.passing.R
barplot.ek.R
bar.plot.simple.R
bin.R
bland.altmann.ek.R
boxplot.ek.R
category.basics.R
category.compactness.R
circle.R
color.matrix.R
color.set.R
count.repeats.int.R
degrees.to.radians.R
errbar.plot.R
generalized.kappa.Gwet.R
gliding.proportion.R
gliding.proportions.table.R
heatmap.ek.R
hist.plot.categorical.R
hist.plot.simple.R
levene.bartlett.R
linfit.ab.R
linfit.R
linfit.ssq.R
list.wso.R
m.chisq.fisher.R
ngs.rpkm.length.R
normHouseKeeping.R
normSpikeIn.R
normSpikeInRegression.R
plot.bar.point.segment.R
pos.max.min.R
replace.NA.col.wise.R
rm.rows.cols.R
roc.ek1.R
rowVars.R
sumup.blocks.R
trim.distribution.R
venn.Diagram.ek.R

chromosome

acgh.f.score.R
plot.chromosome.outline.R
plot.colgroup.rowgroup.R
plot.genome.inline.R
SNP.envelope.R

cluster

agnes.cl.R
local.cluster.optimum.R
pm.cl.R
pv.cl.R
twoDim.cl.R

mtt

adjust.p.R
anova.ek.R
contrast.matrix.R
mtt.perm.R
mtt.R
my.barplot.R
plot.lsd.R
report.R
rnr.R
script.R
test.R

ngs

counts.start.in.window.R
coverage.vec.R
order.chr.R

perm

color.matrix.perm.R
delta.vec.similarity.R
enumeration.search.dep.boots.f90.base.dist.R
enumeration.search.dep.boots.f90.R
enumeration.search.dep.boots.GOnly.ext2f90.R
enumeration.search.dep.boots.GOnly.extf90.distribution.R
enumeration.search.dep.boots.GOnly.extf90.R
enumeration.search.dep.boots.GOnly.f90.R
enumeration.search.dep.ssq.f90.R
estimate.ref.size.impact.R
estimation.sample.size.R
linfit.ab.R
linfit.ssq.R
perm.sub.matrix.to.full.R
perm.testing.1.R
plot.order.comparison.R
plot.profile.R
plot.sample.search.dependencies.R
proximity.bootstrap.sampling.R
reconstruct.biol.R
test.sampling.jitter.R

perm_fortran

tins.examples.ek.R
tins.examples.R
tins.import.R
tins.plot.dependencies.R

publicationCode

pubRsource.R

SNPmatrix

Expression.matrix.R

Survival

0.source.R
multiSurv.R

tdifferential

0.t.diff.load.dependencies.R
adjust.p.R
cut.z.R
F.test.fast.R
label.col.R
multi.diff.R
my.barplot.R
plot.candidate.signals.descending.by.group.R
plot.differential.R
plot.volc.R
report.R
scale.it.R
script.R
shapiro.wilk.test.R
t.differential.R
test tdiff.R
t.test.fast.R
Wilcoxon.Mann.Whitney.U.test.R

thirdparty

subnetworks1.R

var_db

database.R
import.R
main.R