Projekttitel
Identification and characterization of innovative biomarkers for response prediction and target identification for individualized osteosarcoma therapy

Projektleitung
Prof. Dr. med. Michaela Nathrath - michaela.nathrath@klinikum-kassel.de
Dr. rer. nat. Jan Smida - smida@helmholtz-muenchen.de
Dr. med. Daniel Baumhoer - dbaumhoer@mac.com

Ziele
Bei sporadischen Osteosarkomen des Menschen sollen mittels genomweiter Untersuchungen (auf DNA-, RNA- und Proteinebene) molekulargenetische Veränderungen identifiziert und überprüft werden, inwieweit diese Veränderungen zu Entstehung, Metastasierung und Ansprechen auf die Chemotherapie beitragen. Ziel dieser vergleichenden Untersuchungen ist es einerseits, Zielstrukturen für mögliche Therapieansätze zu identifizieren, und andererseits, Biomarker oder Signaturen zu definieren, die eine Vorhersage des Ansprechens auf die Therapie und der Prognose der Patienten mit Osteosarkom ermöglichen.

Arbeitsplanung
Das Projekt ist in folgende Arbeitsschritte gegliedert:

• Genotypisierung der Tumorproben mittels single-nucleotide-polymorphism arrays (SNP-arrays) und Analyse der Allelvariationen
• Evaluierung von Transcriptom- und miRNA-Expression für definierte Regionen und Gene mittels spezifischer RT-PCR-Assays
• Analyse der histologischen Schnitte in neuartigen "Protein-Profiling" Verfahren auf unterschiedliche tumorspezifische Proteinmuster

Ergebnisverwertung
Die Ergebnisse der einzelnen Untersuchungen werden in projektinterner Kooperation statistisch ausgewertet und auf therapeutisches bzw. diagnostisches Potential hin untersucht. Die pseudonymisierte Auswertung der Genom- und Verlaufsdaten für die Identifizierung von Prognosefaktoren erfolgt über die Einbindung des Projektes in die aktuelle Osteosarkombehandlungsstudie/COSS-Studie. Im Falle der Identifikation von möglicherweise therapeutisch oder prognostisch bedeutsamen Biomarkern oder Signaturen ist ein Antrag für eine prospektive Überprüfung im Rahmen der Nachfolgestudie der aktuellen Osteosarkombehandlungsstudie geplant.